南京的产业结构比杭州更全面。南京的互联网产值比杭州高，南京全国第四，杭州全国第五。
南京企业总部品牌：
电子信息类：中电14所、中电55所、中电28所、中电714所、国电南瑞，国电南自，国睿科技、长峰航天、埃斯顿、浩鲸云、满帮集团、福祐在线、冠捷科技、熊猫集团、润和软件、亿嘉和、苏博特、诚迈科技、亚信科技、南大苏富特江苏有线、多伦科技、三宝科技、金智科技、科远智慧、迈拓股份、大烨智能、云创数据、国光信息、欣网通信、维沃软件、烽火天地通信、嘉环科技、华苏科技、擎天科技、好享家、众能联合、蓝洋智能、长晶科技、易云、中车数字、中天安驰、云信达、车享购、爱解答、巴哥租车、斑马软件、行者无疆、巨鲨显示
生物医药类：金瑞斯、健友股份、诺唯赞、南微医学、先声药业、药石科技、伟思医疗、基蛋生物、科思股份、前沿生物、威尔药业、南京医药、金陵药业、海辰药业、奥赛康、世和基金、传奇生物、维立志博、诺曼尔、集萃药康、中科超精、博奥信、轩凯生物、北恒生物、驯鹿医疗、新格元、欧凯生物、霆升科技、诺因生物、海鲸药业、微测生物、南大药业、派格测控
集成电路：芯世界、华瑞微电子、龙众创芯、清矽微电子、德瑞智芯、芯林盛业、酷珀微电子、苏芯物联、芯云电子、澳菲思、宏泰半导体、天易合芯、中晟微电子、极芯通信、绿芯集成
金融类：华泰证券、南京证券、江苏国信、江苏银行、南京银行、紫金银行、江苏租赁、苏宁银行
材料工程类：中材科技、中材股份、中材国际、寒锐钴业、南钢股份、云海金属、宝色股份、红宝丽、新瀚新材、南京化纤、江苏丝绸、苏豪、中路交科
化学工程类：金陵石化、扬子石化、红太阳、龙蟠科技、招商南油、红宝丽
环境工程类：久吾高科、中旗股份、南大环境、中电环保、江南环保、合一环保
电商、商贸：苏宁易购、希音、汇通达、孩子王、苏垦农发、德基、金鹰、中央商场、新百、途牛网、焦点科技(中国制造网)、汇鸿集团、商洛电子、锦鸿集团、我乐家居、千米网、艾佳、
汽车电子：中车浦镇、泉峰控股、航天晨光、康众汽配、开沃新能源、康尼机电、雷尔伟、越博动力、奥联电子、中传南高齿、跃进、大全、大友、的卢技术、中港电力
精密电子：苏美达、新联电子、佳力图、本川智能、冠石股份、国博电子、高华科技、天创电子、北斗农机、海川电子
传媒：凤凰传媒集团、译林出版社、金陵翻译社、稻草熊娱乐、幸福蓝海、江苏广电、大众书网、先锋书店
地产：南京高科、弘扬地产、栖霞建设、银城国际、苏宁环球、苏宁置业、宏图高科、朗诗地产、骋望地产、金城地产
港口运输：南京港、盛航股份、音飞货架、中圣股份、T3出行、
设计：华设集团、迪威尔、苏交科、测绘股份、东大建筑设计院、南大建筑设计院
饭店酒店：金陵饭店、大排档、绿柳居、
造船：中船绿洲、金陵造船、中船724所
食品：卫岗牛奶、雨润集团、桂花鸭、樱桃鸭、南农烧鸡、红森林
服饰鞋类：千百度、圣迪奥、海尔曼斯
其它：南京卷烟厂、金箔集团、南京消防集团、宝庆银楼、通灵珠宝
另外南京还有很多合资、外资企业、研究院所、子公司：西门子、台积电、华为南研所、南京中兴、阿里巴巴华东总部、金龙、大众、福特、长安、马自达、LG乐金、可口可乐、百事可乐等等